Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LIMK1P53667 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK1P53667 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK1P53667 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms