Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOSBP53539 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FOSBP53539 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOSBP53539 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FOSBP53539 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOSBP53539 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOSBP53539 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOSBP53539 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FOSBP53539 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOSBP53539 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOSBP53539 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOSBP53539 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOSBP53539 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOSBP53539 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOSBP53539 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOSBP53539 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOSBP53539 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOSBP53539 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FOSBP53539 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOSBP53539 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOSBP53539 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOSBP53539 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOSBP53539 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOSBP53539 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOSBP53539 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOSBP53539 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOSBP53539 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOSBP53539 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOSBP53539 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOSBP53539 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOSBP53539 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOSBP53539 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOSBP53539 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FOSBP53539 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOSBP53539 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FOSBP53539 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOSBP53539 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOSBP53539 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOSBP53539 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOSBP53539 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FOSBP53539 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOSBP53539 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOSBP53539 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FOSBP53539 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOSBP53539 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOSBP53539 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOSBP53539 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOSBP53539 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOSBP53539 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOSBP53539 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOSBP53539 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOSBP53539 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOSBP53539 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FOSBP53539 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOSBP53539 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FOSBP53539 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOSBP53539 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FOSBP53539 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FOSBP53539 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOSBP53539 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOSBP53539 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOSBP53539 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FOSBP53539 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOSBP53539 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FOSBP53539 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOSBP53539 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FOSBP53539 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FOSBP53539 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOSBP53539 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOSBP53539 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOSBP53539 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOSBP53539 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOSBP53539 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOSBP53539 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOSBP53539 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOSBP53539 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOSBP53539 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOSBP53539 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOSBP53539 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOSBP53539 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOSBP53539 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FOSBP53539 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOSBP53539 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOSBP53539 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOSBP53539 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOSBP53539 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOSBP53539 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOSBP53539 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FOSBP53539 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOSBP53539 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOSBP53539 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FOSBP53539 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOSBP53539 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOSBP53539 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOSBP53539 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOSBP53539 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOSBP53539 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOSBP53539 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOSBP53539 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOSBP53539 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 307.4 ms