Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF138P52744 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF138P52744 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms