Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF135P52742 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF135P52742 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF135P52742 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF135P52742 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF135P52742 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF135P52742 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF135P52742 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF135P52742 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF135P52742 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF135P52742 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF135P52742 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms