Protein–RNA interactions for Protein: P52434

POLR2H, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2HP52434 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2HP52434 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2HP52434 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2HP52434 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2HP52434 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2HP52434 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2HP52434 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2HP52434 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2HP52434 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2HP52434 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2HP52434 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms