Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN2P51788 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN2P51788 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN2P51788 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms