Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATMP50440 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATMP50440 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GATMP50440 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GATMP50440 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GATMP50440 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GATMP50440 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GATMP50440 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GATMP50440 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GATMP50440 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GATMP50440 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GATMP50440 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GATMP50440 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GATMP50440 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GATMP50440 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GATMP50440 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GATMP50440 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GATMP50440 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GATMP50440 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GATMP50440 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GATMP50440 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GATMP50440 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GATMP50440 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GATMP50440 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GATMP50440 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GATMP50440 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GATMP50440 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GATMP50440 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GATMP50440 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GATMP50440 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GATMP50440 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GATMP50440 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GATMP50440 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GATMP50440 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GATMP50440 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GATMP50440 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GATMP50440 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GATMP50440 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GATMP50440 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GATMP50440 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GATMP50440 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GATMP50440 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GATMP50440 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GATMP50440 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATMP50440 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATMP50440 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATMP50440 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATMP50440 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATMP50440 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATMP50440 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATMP50440 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATMP50440 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATMP50440 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATMP50440 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATMP50440 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATMP50440 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATMP50440 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATMP50440 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATMP50440 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATMP50440 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATMP50440 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATMP50440 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATMP50440 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATMP50440 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATMP50440 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATMP50440 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATMP50440 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GATMP50440 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATMP50440 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATMP50440 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GATMP50440 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GATMP50440 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GATMP50440 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GATMP50440 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GATMP50440 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GATMP50440 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GATMP50440 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATMP50440 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATMP50440 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GATMP50440 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GATMP50440 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATMP50440 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATMP50440 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATMP50440 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GATMP50440 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GATMP50440 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GATMP50440 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GATMP50440 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GATMP50440 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GATMP50440 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GATMP50440 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GATMP50440 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GATMP50440 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GATMP50440 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATMP50440 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATMP50440 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATMP50440 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GATMP50440 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATMP50440 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GATMP50440 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms