Protein–RNA interactions for Protein: P49763

PGF, Placenta growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGFP49763 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGFP49763 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGFP49763 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGFP49763 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGFP49763 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGFP49763 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGFP49763 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGFP49763 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGFP49763 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGFP49763 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGFP49763 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGFP49763 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGFP49763 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGFP49763 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGFP49763 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGFP49763 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGFP49763 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGFP49763 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGFP49763 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PGFP49763 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGFP49763 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGFP49763 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGFP49763 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGFP49763 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGFP49763 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGFP49763 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGFP49763 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGFP49763 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGFP49763 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PGFP49763 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGFP49763 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGFP49763 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGFP49763 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGFP49763 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGFP49763 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGFP49763 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGFP49763 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGFP49763 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGFP49763 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PGFP49763 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGFP49763 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGFP49763 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGFP49763 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGFP49763 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGFP49763 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGFP49763 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGFP49763 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGFP49763 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGFP49763 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PGFP49763 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGFP49763 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGFP49763 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGFP49763 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PGFP49763 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGFP49763 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGFP49763 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGFP49763 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGFP49763 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGFP49763 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGFP49763 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PGFP49763 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGFP49763 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGFP49763 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGFP49763 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGFP49763 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGFP49763 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGFP49763 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGFP49763 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGFP49763 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGFP49763 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGFP49763 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGFP49763 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGFP49763 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGFP49763 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGFP49763 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGFP49763 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGFP49763 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGFP49763 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGFP49763 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGFP49763 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PGFP49763 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGFP49763 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGFP49763 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PGFP49763 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGFP49763 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PGFP49763 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGFP49763 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGFP49763 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGFP49763 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGFP49763 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGFP49763 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGFP49763 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGFP49763 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGFP49763 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGFP49763 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGFP49763 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGFP49763 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGFP49763 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGFP49763 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGFP49763 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms