Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK1P49759 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK1P49759 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK1P49759 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK1P49759 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK1P49759 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK1P49759 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK1P49759 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK1P49759 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK1P49759 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK1P49759 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK1P49759 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK1P49759 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK1P49759 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK1P49759 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK1P49759 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK1P49759 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK1P49759 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK1P49759 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK1P49759 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK1P49759 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK1P49759 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK1P49759 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK1P49759 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK1P49759 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK1P49759 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLK1P49759 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK1P49759 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK1P49759 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK1P49759 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK1P49759 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK1P49759 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK1P49759 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK1P49759 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK1P49759 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK1P49759 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK1P49759 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK1P49759 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK1P49759 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK1P49759 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK1P49759 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK1P49759 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK1P49759 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK1P49759 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK1P49759 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK1P49759 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK1P49759 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK1P49759 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK1P49759 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK1P49759 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK1P49759 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK1P49759 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK1P49759 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK1P49759 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK1P49759 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK1P49759 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK1P49759 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK1P49759 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLK1P49759 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK1P49759 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK1P49759 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK1P49759 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK1P49759 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK1P49759 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK1P49759 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK1P49759 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK1P49759 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK1P49759 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK1P49759 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK1P49759 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK1P49759 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK1P49759 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK1P49759 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK1P49759 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK1P49759 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK1P49759 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK1P49759 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK1P49759 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK1P49759 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK1P49759 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK1P49759 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLK1P49759 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms