Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP4P49662 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP4P49662 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP4P49662 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASP4P49662 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASP4P49662 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP4P49662 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP4P49662 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP4P49662 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP4P49662 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP4P49662 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP4P49662 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP4P49662 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP4P49662 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP4P49662 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP4P49662 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP4P49662 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP4P49662 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP4P49662 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP4P49662 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP4P49662 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP4P49662 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP4P49662 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP4P49662 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP4P49662 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP4P49662 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP4P49662 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP4P49662 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP4P49662 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP4P49662 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP4P49662 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP4P49662 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP4P49662 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP4P49662 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP4P49662 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP4P49662 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP4P49662 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP4P49662 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP4P49662 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP4P49662 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP4P49662 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP4P49662 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP4P49662 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP4P49662 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP4P49662 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP4P49662 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP4P49662 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP4P49662 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP4P49662 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP4P49662 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP4P49662 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP4P49662 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP4P49662 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP4P49662 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP4P49662 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP4P49662 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP4P49662 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP4P49662 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP4P49662 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP4P49662 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP4P49662 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP4P49662 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP4P49662 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP4P49662 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP4P49662 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP4P49662 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP4P49662 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP4P49662 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP4P49662 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP4P49662 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP4P49662 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP4P49662 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP4P49662 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP4P49662 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP4P49662 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP4P49662 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP4P49662 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP4P49662 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP4P49662 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP4P49662 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP4P49662 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP4P49662 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP4P49662 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP4P49662 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP4P49662 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP4P49662 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP4P49662 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP4P49662 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP4P49662 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP4P49662 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP4P49662 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP4P49662 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP4P49662 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP4P49662 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP4P49662 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP4P49662 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP4P49662 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP4P49662 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP4P49662 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP4P49662 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms