Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK8P49336 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK8P49336 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK8P49336 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK8P49336 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK8P49336 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK8P49336 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK8P49336 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK8P49336 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK8P49336 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK8P49336 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK8P49336 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK8P49336 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK8P49336 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK8P49336 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK8P49336 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK8P49336 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK8P49336 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK8P49336 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK8P49336 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK8P49336 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK8P49336 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK8P49336 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK8P49336 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CDK8P49336 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CDK8P49336 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK8P49336 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK8P49336 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK8P49336 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK8P49336 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK8P49336 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK8P49336 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK8P49336 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK8P49336 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK8P49336 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK8P49336 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK8P49336 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK8P49336 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK8P49336 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK8P49336 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK8P49336 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK8P49336 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK8P49336 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK8P49336 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK8P49336 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK8P49336 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK8P49336 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK8P49336 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK8P49336 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK8P49336 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK8P49336 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK8P49336 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK8P49336 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK8P49336 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK8P49336 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK8P49336 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK8P49336 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK8P49336 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK8P49336 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK8P49336 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK8P49336 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK8P49336 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK8P49336 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK8P49336 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK8P49336 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK8P49336 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDK8P49336 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK8P49336 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDK8P49336 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK8P49336 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK8P49336 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK8P49336 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK8P49336 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK8P49336 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK8P49336 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK8P49336 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK8P49336 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK8P49336 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK8P49336 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK8P49336 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK8P49336 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK8P49336 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK8P49336 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK8P49336 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK8P49336 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK8P49336 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK8P49336 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK8P49336 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK8P49336 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK8P49336 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK8P49336 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK8P49336 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK8P49336 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK8P49336 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK8P49336 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK8P49336 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK8P49336 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK8P49336 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK8P49336 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK8P49336 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms