Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCAR3P49019 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCAR3P49019 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCAR3P49019 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCAR3P49019 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCAR3P49019 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCAR3P49019 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HCAR3P49019 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HCAR3P49019 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HCAR3P49019 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HCAR3P49019 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HCAR3P49019 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HCAR3P49019 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCAR3P49019 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms