Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PITPNBP48739 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms