Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A6P48664 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A6P48664 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A6P48664 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A6P48664 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A6P48664 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A6P48664 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A6P48664 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A6P48664 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A6P48664 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A6P48664 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A6P48664 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A6P48664 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A6P48664 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms