Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLMP48507 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLMP48507 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLMP48507 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLMP48507 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLMP48507 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLMP48507 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLMP48507 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLMP48507 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLMP48507 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLMP48507 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLMP48507 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLMP48507 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLMP48507 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLMP48507 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLMP48507 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLMP48507 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLMP48507 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLMP48507 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLMP48507 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLMP48507 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLMP48507 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLMP48507 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLMP48507 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLMP48507 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCLMP48507 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCLMP48507 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCLMP48507 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCLMP48507 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLMP48507 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLMP48507 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLMP48507 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLMP48507 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLMP48507 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLMP48507 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLMP48507 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLMP48507 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLMP48507 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLMP48507 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLMP48507 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLMP48507 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLMP48507 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLMP48507 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLMP48507 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLMP48507 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLMP48507 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLMP48507 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLMP48507 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCLMP48507 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCLMP48507 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCLMP48507 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCLMP48507 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GCLMP48507 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCLMP48507 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLMP48507 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLMP48507 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLMP48507 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLMP48507 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLMP48507 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLMP48507 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLMP48507 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLMP48507 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLMP48507 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLMP48507 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLMP48507 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLMP48507 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLMP48507 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLMP48507 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLMP48507 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLMP48507 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLMP48507 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLMP48507 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLMP48507 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCLMP48507 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GCLMP48507 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCLMP48507 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GCLMP48507 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCLMP48507 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCLMP48507 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCLMP48507 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCLMP48507 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCLMP48507 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCLMP48507 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCLMP48507 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCLMP48507 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCLMP48507 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCLMP48507 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms