Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARCN1P48444 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ARCN1P48444 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms