Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RXRGP48443 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RXRGP48443 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RXRGP48443 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RXRGP48443 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RXRGP48443 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RXRGP48443 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RXRGP48443 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RXRGP48443 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RXRGP48443 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RXRGP48443 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RXRGP48443 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RXRGP48443 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RXRGP48443 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RXRGP48443 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RXRGP48443 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RXRGP48443 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RXRGP48443 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RXRGP48443 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RXRGP48443 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RXRGP48443 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RXRGP48443 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RXRGP48443 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RXRGP48443 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RXRGP48443 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RXRGP48443 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RXRGP48443 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RXRGP48443 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RXRGP48443 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RXRGP48443 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RXRGP48443 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RXRGP48443 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RXRGP48443 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RXRGP48443 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RXRGP48443 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RXRGP48443 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RXRGP48443 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RXRGP48443 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RXRGP48443 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RXRGP48443 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RXRGP48443 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RXRGP48443 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RXRGP48443 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RXRGP48443 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RXRGP48443 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RXRGP48443 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RXRGP48443 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RXRGP48443 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RXRGP48443 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RXRGP48443 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RXRGP48443 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RXRGP48443 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RXRGP48443 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RXRGP48443 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RXRGP48443 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RXRGP48443 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RXRGP48443 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RXRGP48443 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RXRGP48443 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RXRGP48443 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RXRGP48443 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RXRGP48443 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RXRGP48443 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RXRGP48443 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RXRGP48443 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RXRGP48443 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RXRGP48443 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RXRGP48443 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RXRGP48443 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RXRGP48443 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RXRGP48443 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RXRGP48443 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RXRGP48443 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RXRGP48443 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RXRGP48443 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RXRGP48443 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RXRGP48443 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RXRGP48443 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RXRGP48443 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RXRGP48443 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RXRGP48443 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RXRGP48443 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RXRGP48443 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RXRGP48443 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RXRGP48443 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RXRGP48443 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RXRGP48443 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RXRGP48443 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RXRGP48443 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RXRGP48443 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RXRGP48443 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RXRGP48443 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RXRGP48443 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RXRGP48443 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RXRGP48443 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RXRGP48443 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RXRGP48443 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RXRGP48443 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RXRGP48443 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RXRGP48443 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms