Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRB2P47870 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms