Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL27AP46776 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL27AP46776 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms