Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRCC3P46736 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCC3P46736 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms