Protein–RNA interactions for Protein: P45973

CBX5, Chromobox protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX5P45973 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX5P45973 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX5P45973 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX5P45973 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX5P45973 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX5P45973 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBX5P45973 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX5P45973 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX5P45973 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX5P45973 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX5P45973 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX5P45973 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX5P45973 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX5P45973 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX5P45973 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBX5P45973 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX5P45973 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX5P45973 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX5P45973 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX5P45973 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBX5P45973 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX5P45973 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX5P45973 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX5P45973 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX5P45973 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX5P45973 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX5P45973 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX5P45973 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX5P45973 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBX5P45973 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX5P45973 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX5P45973 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX5P45973 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX5P45973 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX5P45973 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX5P45973 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX5P45973 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX5P45973 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX5P45973 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX5P45973 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX5P45973 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX5P45973 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX5P45973 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX5P45973 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX5P45973 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX5P45973 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX5P45973 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX5P45973 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX5P45973 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX5P45973 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX5P45973 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX5P45973 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX5P45973 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX5P45973 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX5P45973 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX5P45973 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX5P45973 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX5P45973 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX5P45973 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX5P45973 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX5P45973 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX5P45973 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX5P45973 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX5P45973 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX5P45973 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX5P45973 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX5P45973 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX5P45973 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX5P45973 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX5P45973 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX5P45973 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms