Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCG1P45844 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCG1P45844 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms