Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIK3CBP42338 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms