Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA1P42261 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms