Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 YDL241WYDL241W 372 nt6.11□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 COX20YDR231C 618 nt6.11□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 PDA1YER178W 1263 nt6.11□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 EFM3YJR129C 1020 nt6.11□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 YJR146WYJR146W 354 nt6.11□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 SRY1YKL218C 981 nt6.11□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 DID2YKR035W-A 615 nt6.11□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 YPL257WYPL257W 582 nt6.11□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 snR30snR30 606 nt6.11□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 MCM6YGL201C 3054 nt6.11□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 CST6YIL036W 1764 nt6.11□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 CRF1YDR223W 1404 nt6.1□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 VHS1YDR247W 1386 nt6.1□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 GPA2YER020W 1350 nt6.1□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 YDR541CYDR541C 1035 nt6.1□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 YIA6YIL006W 1122 nt6.1□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 QCR8YJL166W 285 nt6.1□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 PTH2YBL057C 627 nt6.1□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 PRS4YBL068W 981 nt6.1□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 RPS28AYOR167C 204 nt6.1□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 UBA3YPR066W 900 nt6.1□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 ROG3YFR022W 2202 nt6.1□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 YDR278CYDR278C 318 nt6.09□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 EDC2YER035W 438 nt6.09□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 SKI8YGL213C 1194 nt6.09□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 ATP12YJL180C 978 nt6.09□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 BSC4YNL269W 396 nt6.09□□□□□ -1.43
SSZ1P38788 PRP24YMR268C 1335 nt6.08□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 SEC18YBR080C 2277 nt6.08□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YIL086CYIL086C 309 nt6.08□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 SRV2YNL138W 1581 nt6.08□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 PTK2YJR059W 2457 nt6.08□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 AMA1YGR225W 1782 nt6.08□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 NUP49YGL172W 1419 nt6.08□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 MHO1YJR008W 1017 nt6.07□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YLR311CYLR311C 348 nt6.07□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 CTR3YLR411W 726 nt6.07□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 RPC19YNL113W 429 nt6.07□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 MRPS12YNR036C 462 nt6.07□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 MKK2YPL140C 1521 nt6.07□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 VPS5YOR069W 2028 nt6.07□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 CDC34YDR054C 888 nt6.06□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 NCS6YGL211W 1080 nt6.06□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 COA1YIL157C 594 nt6.06□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YLR036CYLR036C 612 nt6.06□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 OGG1YML060W 1131 nt6.06□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 PFA4YOL003C 1137 nt6.06□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YBR027CYBR027C 333 nt6.06□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 MBF1YOR298C-A 456 nt6.06□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YPR109WYPR109W 885 nt6.06□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 IRS4YKR019C 1848 nt6.06□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YFL042CYFL042C 2025 nt6.06□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 GUP2YPL189W 1830 nt6.05□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 FAL1YDR021W 1200 nt6.05□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 PSR1YLL010C 1284 nt6.05□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 IES2YNL215W 963 nt6.05□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 RPO26YPR187W 468 nt6.05□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YHL017WYHL017W 1599 nt6.05□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 VPS70YJR126C 2436 nt6.05□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 CLB2YPR119W 1476 nt6.04□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.04□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 DIN7YDR263C 1293 nt6.04□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YKL077WYKL077W 1179 nt6.04□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt6.04□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 OSW5YMR148W 447 nt6.04□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 HRT1YOL133W 366 nt6.04□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YPR123CYPR123C 435 nt6.04□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 AME1YBR211C 975 nt6.04□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 LDB16YCL005W 771 nt6.04□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 UME1YPL139C 1383 nt6.04□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 ERG7YHR072W 2196 nt6.03□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YGL101WYGL101W 648 nt6.03□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 Q0144Q0144 330 nt6.03□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt6.03□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 MRS1YIR021W 1092 nt6.03□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 MDE1YJR024C 735 nt6.03□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 NPA3YJR072C 1158 nt6.03□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YKL169CYKL169C 384 nt6.03□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 MRPL4YLR439W 960 nt6.03□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 YML083CYML083C 1257 nt6.03□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 FIT2YOR382W 462 nt6.03□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 ALD6YPL061W 1503 nt6.03□□□□□ -1.44
SSZ1P38788 ASN1YPR145W 1719 nt6.02□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 GIT1YCR098C 1557 nt6.02□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 OXP1YKL215C 3861 nt6.02□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 YDL121CYDL121C 450 nt6.02□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 IRC7YFR055W 1023 nt6.02□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 YBL029WYBL029W 1131 nt6.02□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 RIB1YBL033C 1038 nt6.02□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 RUF23RUF23 254 nt6.02□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 KTR1YOR099W 1182 nt6.02□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 DBP9YLR276C 1785 nt6.02□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 LAP2YNL045W 2016 nt6.02□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 YHK8YHR048W 1545 nt6.01□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 SIT1YEL065W 1887 nt6.01□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 ERV14YGL054C 417 nt6.01□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 YLF2YHL014C 1218 nt6.01□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 YHL045WYHL045W 348 nt6.01□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 SOD2YHR008C 702 nt6.01□□□□□ -1.45
SSZ1P38788 LCB3YJL134W 1230 nt6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.3 ms