Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSPA4P34932 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSPA4P34932 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSPA4P34932 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSPA4P34932 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSPA4P34932 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSPA4P34932 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HSPA4P34932 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms