Protein–RNA interactions for Protein: P31431

SDC4, Syndecan-4, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC4P31431 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDC4P31431 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDC4P31431 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDC4P31431 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDC4P31431 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDC4P31431 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDC4P31431 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDC4P31431 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDC4P31431 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDC4P31431 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SDC4P31431 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDC4P31431 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDC4P31431 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDC4P31431 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDC4P31431 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDC4P31431 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDC4P31431 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDC4P31431 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDC4P31431 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDC4P31431 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDC4P31431 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SDC4P31431 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDC4P31431 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDC4P31431 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDC4P31431 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDC4P31431 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDC4P31431 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDC4P31431 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDC4P31431 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SDC4P31431 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDC4P31431 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDC4P31431 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDC4P31431 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDC4P31431 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDC4P31431 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDC4P31431 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDC4P31431 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDC4P31431 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDC4P31431 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SDC4P31431 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDC4P31431 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDC4P31431 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDC4P31431 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDC4P31431 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDC4P31431 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDC4P31431 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDC4P31431 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDC4P31431 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDC4P31431 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDC4P31431 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDC4P31431 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDC4P31431 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDC4P31431 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDC4P31431 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDC4P31431 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDC4P31431 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDC4P31431 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDC4P31431 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDC4P31431 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDC4P31431 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDC4P31431 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDC4P31431 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SDC4P31431 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDC4P31431 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDC4P31431 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDC4P31431 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDC4P31431 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDC4P31431 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDC4P31431 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDC4P31431 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDC4P31431 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDC4P31431 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDC4P31431 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SDC4P31431 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDC4P31431 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDC4P31431 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDC4P31431 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDC4P31431 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDC4P31431 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDC4P31431 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDC4P31431 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SDC4P31431 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDC4P31431 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDC4P31431 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDC4P31431 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDC4P31431 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDC4P31431 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDC4P31431 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDC4P31431 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SDC4P31431 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDC4P31431 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDC4P31431 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDC4P31431 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDC4P31431 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDC4P31431 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDC4P31431 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDC4P31431 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDC4P31431 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDC4P31431 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDC4P31431 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms