Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CPS1P31327 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CPS1P31327 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CPS1P31327 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CPS1P31327 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CPS1P31327 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CPS1P31327 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CPS1P31327 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CPS1P31327 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CPS1P31327 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CPS1P31327 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CPS1P31327 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CPS1P31327 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CPS1P31327 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CPS1P31327 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CPS1P31327 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CPS1P31327 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CPS1P31327 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CPS1P31327 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CPS1P31327 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CPS1P31327 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CPS1P31327 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CPS1P31327 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CPS1P31327 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CPS1P31327 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CPS1P31327 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CPS1P31327 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CPS1P31327 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CPS1P31327 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CPS1P31327 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CPS1P31327 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CPS1P31327 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CPS1P31327 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CPS1P31327 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CPS1P31327 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CPS1P31327 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CPS1P31327 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CPS1P31327 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CPS1P31327 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CPS1P31327 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CPS1P31327 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CPS1P31327 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CPS1P31327 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CPS1P31327 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CPS1P31327 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CPS1P31327 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CPS1P31327 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CPS1P31327 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CPS1P31327 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CPS1P31327 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CPS1P31327 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CPS1P31327 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CPS1P31327 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CPS1P31327 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CPS1P31327 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CPS1P31327 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CPS1P31327 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CPS1P31327 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CPS1P31327 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CPS1P31327 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CPS1P31327 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CPS1P31327 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CPS1P31327 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CPS1P31327 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CPS1P31327 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CPS1P31327 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CPS1P31327 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CPS1P31327 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CPS1P31327 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CPS1P31327 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CPS1P31327 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CPS1P31327 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CPS1P31327 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CPS1P31327 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CPS1P31327 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CPS1P31327 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CPS1P31327 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CPS1P31327 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CPS1P31327 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CPS1P31327 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CPS1P31327 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CPS1P31327 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CPS1P31327 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CPS1P31327 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CPS1P31327 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CPS1P31327 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CPS1P31327 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CPS1P31327 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CPS1P31327 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CPS1P31327 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CPS1P31327 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CPS1P31327 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CPS1P31327 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CPS1P31327 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CPS1P31327 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CPS1P31327 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CPS1P31327 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CPS1P31327 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CPS1P31327 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CPS1P31327 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms