Protein–RNA interactions for Protein: P30876

POLR2B, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2BP30876 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2BP30876 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2BP30876 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2BP30876 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2BP30876 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2BP30876 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2BP30876 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2BP30876 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2BP30876 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2BP30876 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2BP30876 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms