Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC27P30260 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC27P30260 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC27P30260 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC27P30260 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC27P30260 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC27P30260 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC27P30260 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC27P30260 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC27P30260 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC27P30260 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC27P30260 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC27P30260 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC27P30260 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC27P30260 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC27P30260 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC27P30260 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC27P30260 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC27P30260 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC27P30260 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC27P30260 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC27P30260 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC27P30260 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC27P30260 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC27P30260 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC27P30260 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC27P30260 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC27P30260 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC27P30260 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC27P30260 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC27P30260 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC27P30260 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC27P30260 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC27P30260 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC27P30260 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC27P30260 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC27P30260 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC27P30260 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC27P30260 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC27P30260 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC27P30260 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC27P30260 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC27P30260 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC27P30260 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC27P30260 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC27P30260 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDC27P30260 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDC27P30260 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC27P30260 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC27P30260 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC27P30260 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC27P30260 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC27P30260 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC27P30260 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC27P30260 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC27P30260 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC27P30260 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC27P30260 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC27P30260 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC27P30260 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC27P30260 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC27P30260 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC27P30260 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC27P30260 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC27P30260 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC27P30260 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC27P30260 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC27P30260 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC27P30260 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC27P30260 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC27P30260 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC27P30260 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC27P30260 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC27P30260 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC27P30260 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC27P30260 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC27P30260 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC27P30260 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC27P30260 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC27P30260 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC27P30260 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC27P30260 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC27P30260 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC27P30260 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC27P30260 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC27P30260 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC27P30260 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC27P30260 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC27P30260 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC27P30260 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC27P30260 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC27P30260 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC27P30260 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CDC27P30260 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC27P30260 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC27P30260 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC27P30260 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC27P30260 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDC27P30260 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC27P30260 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms