Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
GTF2E1P29083 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GTF2E1P29083 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms