Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRB3P28472 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRB3P28472 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB3P28472 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB3P28472 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.7 ms