Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CANXP27824 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CANXP27824 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CANXP27824 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CANXP27824 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CANXP27824 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CANXP27824 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CANXP27824 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CANXP27824 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CANXP27824 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CANXP27824 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CANXP27824 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CANXP27824 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CANXP27824 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CANXP27824 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CANXP27824 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CANXP27824 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CANXP27824 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CANXP27824 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CANXP27824 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CANXP27824 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CANXP27824 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CANXP27824 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CANXP27824 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CANXP27824 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CANXP27824 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CANXP27824 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CANXP27824 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CANXP27824 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CANXP27824 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CANXP27824 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CANXP27824 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CANXP27824 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CANXP27824 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CANXP27824 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CANXP27824 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CANXP27824 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CANXP27824 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CANXP27824 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CANXP27824 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CANXP27824 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CANXP27824 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CANXP27824 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CANXP27824 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CANXP27824 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CANXP27824 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CANXP27824 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CANXP27824 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CANXP27824 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CANXP27824 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CANXP27824 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CANXP27824 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CANXP27824 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CANXP27824 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CANXP27824 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CANXP27824 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CANXP27824 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CANXP27824 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CANXP27824 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CANXP27824 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CANXP27824 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CANXP27824 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CANXP27824 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CANXP27824 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CANXP27824 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CANXP27824 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CANXP27824 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CANXP27824 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CANXP27824 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CANXP27824 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CANXP27824 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CANXP27824 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CANXP27824 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CANXP27824 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CANXP27824 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CANXP27824 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CANXP27824 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CANXP27824 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CANXP27824 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CANXP27824 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CANXP27824 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CANXP27824 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CANXP27824 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CANXP27824 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CANXP27824 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CANXP27824 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CANXP27824 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CANXP27824 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CANXP27824 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CANXP27824 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CANXP27824 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CANXP27824 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CANXP27824 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CANXP27824 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CANXP27824 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CANXP27824 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CANXP27824 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CANXP27824 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CANXP27824 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CANXP27824 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms