Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNTFRP26992 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNTFRP26992 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms