Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IVDP26440 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IVDP26440 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IVDP26440 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IVDP26440 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IVDP26440 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IVDP26440 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IVDP26440 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IVDP26440 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IVDP26440 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IVDP26440 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IVDP26440 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IVDP26440 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IVDP26440 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IVDP26440 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IVDP26440 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IVDP26440 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IVDP26440 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IVDP26440 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IVDP26440 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IVDP26440 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IVDP26440 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IVDP26440 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IVDP26440 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IVDP26440 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IVDP26440 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IVDP26440 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IVDP26440 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IVDP26440 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IVDP26440 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IVDP26440 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IVDP26440 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IVDP26440 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IVDP26440 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IVDP26440 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IVDP26440 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IVDP26440 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IVDP26440 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IVDP26440 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IVDP26440 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IVDP26440 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IVDP26440 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IVDP26440 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IVDP26440 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IVDP26440 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IVDP26440 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IVDP26440 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IVDP26440 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IVDP26440 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IVDP26440 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IVDP26440 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IVDP26440 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IVDP26440 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IVDP26440 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IVDP26440 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IVDP26440 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IVDP26440 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IVDP26440 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IVDP26440 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IVDP26440 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IVDP26440 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IVDP26440 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IVDP26440 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IVDP26440 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IVDP26440 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IVDP26440 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IVDP26440 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IVDP26440 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IVDP26440 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IVDP26440 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IVDP26440 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IVDP26440 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IVDP26440 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IVDP26440 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IVDP26440 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IVDP26440 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IVDP26440 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IVDP26440 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IVDP26440 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IVDP26440 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IVDP26440 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IVDP26440 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IVDP26440 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IVDP26440 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IVDP26440 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IVDP26440 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IVDP26440 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IVDP26440 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IVDP26440 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IVDP26440 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IVDP26440 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IVDP26440 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IVDP26440 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IVDP26440 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IVDP26440 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IVDP26440 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IVDP26440 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IVDP26440 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IVDP26440 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IVDP26440 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms