Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF4BP23588 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4BP23588 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms