Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR4A1P22736 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms