Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCP2P22307 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCP2P22307 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCP2P22307 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCP2P22307 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCP2P22307 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCP2P22307 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCP2P22307 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCP2P22307 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCP2P22307 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCP2P22307 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCP2P22307 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCP2P22307 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCP2P22307 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCP2P22307 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCP2P22307 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCP2P22307 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCP2P22307 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCP2P22307 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCP2P22307 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCP2P22307 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCP2P22307 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCP2P22307 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCP2P22307 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCP2P22307 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCP2P22307 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCP2P22307 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCP2P22307 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCP2P22307 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCP2P22307 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCP2P22307 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCP2P22307 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCP2P22307 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCP2P22307 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCP2P22307 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCP2P22307 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCP2P22307 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCP2P22307 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCP2P22307 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCP2P22307 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCP2P22307 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCP2P22307 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCP2P22307 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCP2P22307 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCP2P22307 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCP2P22307 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCP2P22307 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCP2P22307 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCP2P22307 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCP2P22307 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCP2P22307 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCP2P22307 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCP2P22307 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCP2P22307 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCP2P22307 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCP2P22307 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCP2P22307 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCP2P22307 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCP2P22307 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCP2P22307 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCP2P22307 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCP2P22307 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCP2P22307 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCP2P22307 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCP2P22307 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCP2P22307 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCP2P22307 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCP2P22307 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCP2P22307 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCP2P22307 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCP2P22307 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCP2P22307 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCP2P22307 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCP2P22307 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCP2P22307 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCP2P22307 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCP2P22307 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCP2P22307 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCP2P22307 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCP2P22307 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCP2P22307 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCP2P22307 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCP2P22307 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCP2P22307 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCP2P22307 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCP2P22307 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCP2P22307 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCP2P22307 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCP2P22307 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCP2P22307 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCP2P22307 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCP2P22307 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCP2P22307 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCP2P22307 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCP2P22307 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCP2P22307 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCP2P22307 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCP2P22307 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCP2P22307 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SCP2P22307 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms