Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP3P21580 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP3P21580 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP3P21580 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms