Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTNP21246 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTNP21246 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTNP21246 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTNP21246 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTNP21246 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTNP21246 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTNP21246 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTNP21246 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTNP21246 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTNP21246 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTNP21246 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTNP21246 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTNP21246 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTNP21246 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTNP21246 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTNP21246 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTNP21246 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTNP21246 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTNP21246 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTNP21246 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTNP21246 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTNP21246 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTNP21246 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTNP21246 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTNP21246 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTNP21246 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTNP21246 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTNP21246 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTNP21246 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTNP21246 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTNP21246 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTNP21246 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTNP21246 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTNP21246 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTNP21246 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTNP21246 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTNP21246 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTNP21246 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTNP21246 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTNP21246 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTNP21246 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTNP21246 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTNP21246 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTNP21246 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTNP21246 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTNP21246 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTNP21246 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTNP21246 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTNP21246 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTNP21246 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTNP21246 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTNP21246 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTNP21246 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTNP21246 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTNP21246 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTNP21246 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTNP21246 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTNP21246 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTNP21246 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTNP21246 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTNP21246 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTNP21246 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTNP21246 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTNP21246 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTNP21246 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTNP21246 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTNP21246 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTNP21246 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTNP21246 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTNP21246 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTNP21246 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTNP21246 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTNP21246 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTNP21246 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTNP21246 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTNP21246 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTNP21246 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTNP21246 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTNP21246 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTNP21246 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTNP21246 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTNP21246 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTNP21246 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTNP21246 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTNP21246 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTNP21246 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTNP21246 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTNP21246 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTNP21246 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTNP21246 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTNP21246 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTNP21246 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTNP21246 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTNP21246 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTNP21246 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTNP21246 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTNP21246 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTNP21246 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTNP21246 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms