Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RASA1P20936 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RASA1P20936 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RASA1P20936 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RASA1P20936 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASA1P20936 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASA1P20936 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASA1P20936 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASA1P20936 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASA1P20936 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASA1P20936 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASA1P20936 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASA1P20936 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASA1P20936 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RASA1P20936 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RASA1P20936 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASA1P20936 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASA1P20936 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASA1P20936 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASA1P20936 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASA1P20936 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASA1P20936 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASA1P20936 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASA1P20936 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASA1P20936 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RASA1P20936 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RASA1P20936 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASA1P20936 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RASA1P20936 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASA1P20936 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASA1P20936 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASA1P20936 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASA1P20936 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RASA1P20936 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RASA1P20936 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RASA1P20936 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RASA1P20936 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RASA1P20936 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RASA1P20936 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RASA1P20936 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RASA1P20936 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RASA1P20936 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RASA1P20936 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RASA1P20936 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASA1P20936 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASA1P20936 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RASA1P20936 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASA1P20936 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASA1P20936 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASA1P20936 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASA1P20936 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASA1P20936 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASA1P20936 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASA1P20936 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASA1P20936 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASA1P20936 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RASA1P20936 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RASA1P20936 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RASA1P20936 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RASA1P20936 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RASA1P20936 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASA1P20936 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASA1P20936 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RASA1P20936 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASA1P20936 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASA1P20936 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASA1P20936 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASA1P20936 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASA1P20936 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASA1P20936 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASA1P20936 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RASA1P20936 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASA1P20936 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASA1P20936 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASA1P20936 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASA1P20936 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASA1P20936 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASA1P20936 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASA1P20936 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASA1P20936 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASA1P20936 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASA1P20936 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASA1P20936 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASA1P20936 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASA1P20936 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASA1P20936 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RASA1P20936 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASA1P20936 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RASA1P20936 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RASA1P20936 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RASA1P20936 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RASA1P20936 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RASA1P20936 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RASA1P20936 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RASA1P20936 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RASA1P20936 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RASA1P20936 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RASA1P20936 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RASA1P20936 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RASA1P20936 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms