Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMY2BP19961 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AMY2BP19961 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMY2BP19961 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms