Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFE3P19532 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFE3P19532 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFE3P19532 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFE3P19532 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFE3P19532 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFE3P19532 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFE3P19532 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TFE3P19532 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFE3P19532 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFE3P19532 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFE3P19532 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TFE3P19532 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFE3P19532 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFE3P19532 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFE3P19532 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFE3P19532 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFE3P19532 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFE3P19532 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFE3P19532 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFE3P19532 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFE3P19532 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFE3P19532 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TFE3P19532 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFE3P19532 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFE3P19532 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFE3P19532 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFE3P19532 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFE3P19532 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFE3P19532 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFE3P19532 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFE3P19532 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFE3P19532 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TFE3P19532 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFE3P19532 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFE3P19532 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFE3P19532 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFE3P19532 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFE3P19532 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFE3P19532 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFE3P19532 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFE3P19532 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFE3P19532 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFE3P19532 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFE3P19532 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFE3P19532 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFE3P19532 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFE3P19532 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFE3P19532 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFE3P19532 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFE3P19532 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFE3P19532 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFE3P19532 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFE3P19532 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFE3P19532 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFE3P19532 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFE3P19532 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFE3P19532 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFE3P19532 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFE3P19532 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFE3P19532 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFE3P19532 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFE3P19532 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFE3P19532 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFE3P19532 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFE3P19532 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFE3P19532 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFE3P19532 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFE3P19532 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFE3P19532 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFE3P19532 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFE3P19532 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFE3P19532 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFE3P19532 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFE3P19532 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFE3P19532 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFE3P19532 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TFE3P19532 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFE3P19532 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFE3P19532 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFE3P19532 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFE3P19532 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFE3P19532 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFE3P19532 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFE3P19532 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFE3P19532 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFE3P19532 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFE3P19532 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFE3P19532 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TFE3P19532 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFE3P19532 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFE3P19532 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFE3P19532 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFE3P19532 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFE3P19532 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TFE3P19532 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFE3P19532 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFE3P19532 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFE3P19532 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFE3P19532 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms