Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT15P19012 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT15P19012 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT15P19012 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT15P19012 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT15P19012 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT15P19012 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT15P19012 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT15P19012 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT15P19012 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT15P19012 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT15P19012 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT15P19012 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT15P19012 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT15P19012 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT15P19012 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT15P19012 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT15P19012 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT15P19012 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT15P19012 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT15P19012 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT15P19012 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT15P19012 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT15P19012 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT15P19012 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT15P19012 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT15P19012 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT15P19012 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT15P19012 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT15P19012 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT15P19012 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT15P19012 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT15P19012 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT15P19012 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT15P19012 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT15P19012 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT15P19012 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT15P19012 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT15P19012 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT15P19012 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT15P19012 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT15P19012 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT15P19012 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT15P19012 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT15P19012 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT15P19012 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT15P19012 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT15P19012 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT15P19012 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT15P19012 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT15P19012 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT15P19012 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT15P19012 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT15P19012 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT15P19012 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT15P19012 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT15P19012 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT15P19012 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT15P19012 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT15P19012 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT15P19012 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT15P19012 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT15P19012 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT15P19012 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT15P19012 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT15P19012 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT15P19012 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT15P19012 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT15P19012 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT15P19012 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT15P19012 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT15P19012 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT15P19012 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT15P19012 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT15P19012 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT15P19012 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT15P19012 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT15P19012 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT15P19012 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT15P19012 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT15P19012 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT15P19012 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT15P19012 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT15P19012 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT15P19012 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT15P19012 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT15P19012 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT15P19012 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT15P19012 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT15P19012 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT15P19012 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT15P19012 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT15P19012 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT15P19012 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT15P19012 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT15P19012 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT15P19012 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT15P19012 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT15P19012 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT15P19012 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms