Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRAP18433 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRAP18433 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRAP18433 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms