Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD46P15529 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD46P15529 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD46P15529 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CD46P15529 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CD46P15529 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD46P15529 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD46P15529 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD46P15529 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD46P15529 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD46P15529 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD46P15529 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD46P15529 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD46P15529 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD46P15529 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD46P15529 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD46P15529 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD46P15529 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD46P15529 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD46P15529 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD46P15529 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD46P15529 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD46P15529 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD46P15529 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD46P15529 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD46P15529 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD46P15529 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD46P15529 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD46P15529 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD46P15529 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD46P15529 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD46P15529 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD46P15529 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD46P15529 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD46P15529 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CD46P15529 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD46P15529 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD46P15529 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD46P15529 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD46P15529 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD46P15529 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD46P15529 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD46P15529 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD46P15529 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD46P15529 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CD46P15529 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD46P15529 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD46P15529 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD46P15529 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD46P15529 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD46P15529 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CD46P15529 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD46P15529 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD46P15529 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD46P15529 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD46P15529 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD46P15529 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD46P15529 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD46P15529 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD46P15529 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD46P15529 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CD46P15529 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD46P15529 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CD46P15529 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD46P15529 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD46P15529 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD46P15529 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD46P15529 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD46P15529 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD46P15529 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD46P15529 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD46P15529 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD46P15529 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD46P15529 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD46P15529 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CD46P15529 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD46P15529 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD46P15529 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD46P15529 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD46P15529 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD46P15529 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD46P15529 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD46P15529 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD46P15529 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD46P15529 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD46P15529 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD46P15529 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD46P15529 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD46P15529 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD46P15529 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD46P15529 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CD46P15529 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CD46P15529 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD46P15529 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD46P15529 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD46P15529 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD46P15529 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD46P15529 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CD46P15529 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD46P15529 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms