Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPGDP15428 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPGDP15428 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPGDP15428 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPGDP15428 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPGDP15428 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPGDP15428 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPGDP15428 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HPGDP15428 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPGDP15428 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPGDP15428 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPGDP15428 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HPGDP15428 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPGDP15428 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPGDP15428 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPGDP15428 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPGDP15428 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPGDP15428 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPGDP15428 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPGDP15428 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPGDP15428 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPGDP15428 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPGDP15428 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPGDP15428 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPGDP15428 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HPGDP15428 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPGDP15428 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPGDP15428 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPGDP15428 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPGDP15428 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPGDP15428 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPGDP15428 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPGDP15428 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HPGDP15428 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPGDP15428 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPGDP15428 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDP15428 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDP15428 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDP15428 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDP15428 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDP15428 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDP15428 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDP15428 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDP15428 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDP15428 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDP15428 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDP15428 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDP15428 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDP15428 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDP15428 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDP15428 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDP15428 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDP15428 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDP15428 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPGDP15428 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPGDP15428 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HPGDP15428 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPGDP15428 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPGDP15428 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPGDP15428 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPGDP15428 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPGDP15428 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPGDP15428 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPGDP15428 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPGDP15428 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPGDP15428 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPGDP15428 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPGDP15428 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPGDP15428 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPGDP15428 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPGDP15428 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPGDP15428 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPGDP15428 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPGDP15428 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPGDP15428 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPGDP15428 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPGDP15428 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPGDP15428 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPGDP15428 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPGDP15428 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPGDP15428 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPGDP15428 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPGDP15428 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HPGDP15428 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPGDP15428 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPGDP15428 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPGDP15428 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPGDP15428 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPGDP15428 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPGDP15428 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPGDP15428 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPGDP15428 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPGDP15428 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPGDP15428 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPGDP15428 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPGDP15428 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPGDP15428 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPGDP15428 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPGDP15428 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPGDP15428 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms