Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC5A1P13866 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC5A1P13866 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SLC5A1P13866 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC5A1P13866 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms