Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLS3P13797 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLS3P13797 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLS3P13797 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLS3P13797 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLS3P13797 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLS3P13797 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLS3P13797 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLS3P13797 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLS3P13797 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLS3P13797 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLS3P13797 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLS3P13797 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLS3P13797 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLS3P13797 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLS3P13797 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLS3P13797 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLS3P13797 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLS3P13797 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLS3P13797 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLS3P13797 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLS3P13797 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PLS3P13797 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLS3P13797 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PLS3P13797 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLS3P13797 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLS3P13797 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLS3P13797 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLS3P13797 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLS3P13797 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLS3P13797 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLS3P13797 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLS3P13797 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLS3P13797 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PLS3P13797 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLS3P13797 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLS3P13797 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLS3P13797 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLS3P13797 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLS3P13797 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLS3P13797 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PLS3P13797 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLS3P13797 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLS3P13797 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLS3P13797 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLS3P13797 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLS3P13797 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLS3P13797 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLS3P13797 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLS3P13797 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PLS3P13797 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLS3P13797 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLS3P13797 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLS3P13797 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLS3P13797 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLS3P13797 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLS3P13797 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLS3P13797 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLS3P13797 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLS3P13797 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLS3P13797 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLS3P13797 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLS3P13797 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLS3P13797 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLS3P13797 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLS3P13797 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLS3P13797 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLS3P13797 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLS3P13797 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLS3P13797 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLS3P13797 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLS3P13797 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLS3P13797 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLS3P13797 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PLS3P13797 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLS3P13797 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLS3P13797 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLS3P13797 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLS3P13797 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLS3P13797 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLS3P13797 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLS3P13797 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLS3P13797 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLS3P13797 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLS3P13797 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PLS3P13797 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLS3P13797 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLS3P13797 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLS3P13797 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLS3P13797 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLS3P13797 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLS3P13797 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLS3P13797 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLS3P13797 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLS3P13797 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLS3P13797 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLS3P13797 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLS3P13797 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLS3P13797 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLS3P13797 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms