Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYP2C9P11712 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP2C9P11712 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms